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临床宏基因组学的应用

2021/4/26 14:20:22   来源:

简介

宏基因组( Metagenome)是生境中全部微小生物遗传物质的总和,它包含了可培养的和不可培养的微生物的基因组。宏基因组学就是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,以测序技术和生物信息学分析技术为研究手段,对微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及微生物与环境之间的关系进行研究。从而解读微生物群体多样性与丰度,探求微生物与环境,微生物与宿主之间的关系,发掘和研究新的、具有特定功能的基因。
临床宏基因组学-Clinical metagenomic next-generation sequencing (mNGS)是对患者样本中微生物和宿主遗传物质(DNA和RNA)进行综合分析的一种新兴的诊断技术,这种新兴的方法正在改变医生诊断和治疗疾病的方式,其应用范围广泛,其应用范围包括抗菌素耐药性研究、微生物组学、人类宿主基因表达(转录组学)和肿瘤学。

临床微生物学研究应用领域

  1. 病原体鉴定:如对各种传染病及综合征的样本进行病原体鉴定。
  2. 病原微生物组学研究:对疾病和健康状态下的微生物组进行分析,以及人类宿主在感染病原体后的转录组学分析,以及肿瘤相关病毒及其基因组整合位点的鉴定。
  3. 公共卫生:从临床样本中鉴定病原体以指导感染患者的管理和治疗策略、公共卫生微生物学和监测社区内的传染病暴发源等。

宏基因组分析流程

宏基因组分析流程